1 min read

新起点、新征程

博客好久没有更新了,意味着好久没有写代码了。最大的问题是,时间越来越碎片化,没有太多时间坐下来仔细研究代码。

这两年的成果不算多。除了一些常规性的工作,可以梳理出来的亮点不多:

  1. “黄海芯1号"芯片(55K SNP)及其衍生的两款芯片(1K、10K SNP)。这三款芯片,可以说为GS提供了可靠并且趁手的高通量基因分型工具。屠龙刀有了,接下来最大的问题是,龙在哪里?如何找到龙?找到龙之前还要做哪些工作?高质量参考基因组组装、高质量基因型填充参考群体构建等工作,绕不过去。大规模基因组选择参考群体构建,是必须要做的工作。如何构建,做到低成本高效率,需要好好设计。这些工作想想真的是任重道远,但又时不待我。
  2. 一些复杂性状的复杂遗传评估模型的构建。譬如整齐度性状,基本解决了遗传评估模型构建的问题。接下来,最大的问题是,如何获得大规模测试数据,提高遗传参数估计和选择的准确性。
  3. 一些高效育种模式的计算机模拟工作。如ONBS、高生物安全育种模式等,模拟的流程基本上建立起来了,目前来看进展和结果还不错。
  4. 多组学数据的综合使用。这一块处于探索阶段,GS、GWAS、TWAS、eQTL等,还没有一个清晰的结果和路线。其实熟悉线型混合模型,GWAS的分析是非常简单的工作。之前没介入,实际分析后发现真的是轻松切入。
  5. 重要经济性状的高通量表型测定。这一块主要是跟第三方合作,解决人工耗时费力且不准确的问题。目前生长表型的高通量测定已经基本解决,正在解决抗病性状的高通量表型测定。

上述工作,最后整理出文章的进度还是太慢,需要加快进度,发出2-3篇有影响力的文章来。

2023年的变化较大,自己的定位也发生了改变。以后的工作,更多的需要从团队、"育繁推"作为一个整体去考虑。遗传评估和方法研究的推进速度可能会慢,需要培养新人,尽快把工作推进起来。以后可能要暂时放弃代码编写,很难再有机会享受那种专心写代码、问题解决,多巴胺大量分泌的时刻了。