配置git，并将代码库上传到github这个过程是非常繁琐的，所以一直没有详细写。最近临时换了一台电脑，不得不重新配置，因此把整个过程又重新走了一遍，借此机会记录下来。
整个过程可以参照这本电子书：《Happy Git and GitHub for the useR》，写的非常详细，但是英文读起来还是比较痛苦。
下述过程是在win 10系统上的配置过程。
安装git
从这个地址安装即可。Git跟github并不是一回事。Git是一个版本控制系统程序，用来记录你的电脑上对代码的每一处细微的修改。而Github是一个网站，用来远程存储你的代码库各个修改版本。
Git的官方解释：
Git is a free and open source distributed version control system designed to handle everything from small to very large projects with speed and efficiency.
关于Git的操作，可以看《廖雪峰的网站》。讲解的非常详细。
安装好以后，从开始菜单中找到"Git Bash"，输入下边命令，对git进行简单配置，告诉git作者的名字（譬如张三，名字要用英文如拼音San Zhang）和邮箱（譬如zhangsan@163.com）：
git config --global user.name "San Zhang"
git config --global user.email "zhangsan@163.com"
git config --global --list
最后一条命令，查看配置是否成功。
git使用
具体参照廖雪峰文档。简单举个例子。譬如新建一个文件夹myrepo，用于保存你的项目代码。
在Rstudio中新建一个readme.txt文档，保存在myrepo文件夹中。注意文件要保存为utf-8格式。关于Rstudio的一些设置，可以参考之前的blog。
通过Git Bash启动Bash shell。输入以下命令，初始化该文件夹，作为代码仓库。
git init
接下来，把文件readme.txt添加到初始化成功的代码库中。这样以后对于readme.txt的任何修改，就会被git记录下来。
git add readme.txt
然后对本次提交行为，进行记录说明，方便后续修改回溯。
git commit -m "Added the readme file"
接下来，我们尝试把myrepo中的内容同步保存到github网站上。
注册一个github账户
到github官网注册一个账户。假设申请成功的用户名为zhangsan，后边我们会用到这个名字。
生成SSH key
把本地代码传输到github，一般是通过SSH协议。我们需要生成一个本地电脑的SSH key，保存到github网站上。生成SSH Key的命令为：
ssh-keygen -t rsa -C "zhangsan@163.com"
成功的话，你会在用户主目录下发现.ssh目录，里边保存了id_rsa和id_rsa.pub两个文件，这两个就是SSH Key的秘钥对，id_rsa是私钥，不能泄露出去，id_rsa.pub是公钥，可以放心地告诉任何人。
将id_rsa.pub保存到github网站上
具体做法为：
登陆GitHub，打开“Account settings”，“SSH Keys”页面：
然后，点“Add SSH Key”，填上任意Title（建议以你电脑的英文名字标注，因为可能会从多个不同的电脑终端提交相同的代码，需要提交多个电脑终端的公钥），在Key文本框里粘贴id_rsa.pub文件的内容。
具体可参考廖雪峰的学习教程
生成PAT
如果计划通过https协议提交代码，可以考虑生成PAT（personal access token）。具体可参考《Chapter 10 Cache credentials for HTTPS》
首先通过R包usethis来生成PAT：
usethis::create_github_token()
注意一定要及时保存生成的PAT。
然后通过R包gitcreds中的gitcreds_set()函数，将PAT写入当前电脑中。
library(gitcreds)
gitcreds_set()
在github网站上建立一个空的远程仓库myrepo
具体方法参照廖雪峰教程。
将代码库远程存储到github网站上
启动Git Bash，需要在本地myrepo文件夹下执行以下操作。
git branch -M main #确保提交的是主分支
git remote add origin git@github.com:zhangsan/myrepo.git
git push -u origin main
请注意，其中zhangsan为在github上申请成功的用户名。
如果平常的工作是在Rstudio中写代码，感觉又记不住这些复杂的git命令。可以考虑使用Rstudio中简易的git客户端功能。我个人在使用，感觉够用。
在Rstudio中设置Git
依次点击菜单Tools–>Global Options–>Git/SVN，确保Git程序被发现，SSH RSA Key（私钥）文件已经正确填写。
一般在win 10系统中，git.exe默认路径为C:/Program Files/Git/bin/git.exe。
私钥文件如前所述，一般是在用户目录下.ssh文件夹中，名称默认为id_rsa文件。
具体可参考该链接配置。
配置好之后，就可以打开Rstudio，写好新的R脚本，保存在myrepo文件夹中，然后通过Rstudio中的git面板来进行Commit、Push和Pull。